Основными функциями учреждения являются организационно-методическая, пропагандистская, издательская деятельность.
КУОЗ «Харьковский городской центр здоровья» организует и проводит информационно-разъяснительную работу среди населения города Харькова с привлечением средств массовой информации, а также через лечебно-профилактические учреждения города и учреждения образования организует проведение санитарно-просветительной работы по пропаганде здорового образа жизни и профилактике различных заболеваний.
В своей работе «Харьковский городской центр здоровья» тесно сотрудничает с научными медицинскими учреждениями (ХМАПО, ХНМУ, институт терапии им. Л.Т. Малой АМН Украины и др.).
Сотрудники центра принимают участие в работе научных съездов, симпозиумов, конференций, семинаров с целью освещения вопросов пропаганды здорового образа жизни, профилактики заболеваний.
Сотрудники центра принимают непосредственное участие в организации и проведении лекций, семинаров, конференций в лечебно-профилактических учреждениях, учреждениях образования и детских дошкольных учреждениях.
Ежемесячно организует проведение «Дней специалиста» для медработников города, а также издает наглядную агитацию (листовки, памятки, буклеты) по актуальным проблемам пропаганды здорового образа жизни.